Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc50Q810U5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms