Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Liat1Q810M6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Liat1Q810M6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms