Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm5bQ80Y84 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kdm5bQ80Y84 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms