Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpp38Q80UU2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpp38Q80UU2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms