Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp8Q80U87 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usp8Q80U87 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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