Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja2Q80U04 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja2Q80U04 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms