Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NischQ80TM9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NischQ80TM9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms