Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms