Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ClmQ7TSN2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms