Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI0

Znf12, Zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf12Q7TSI0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf12Q7TSI0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf12Q7TSI0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms