Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms