Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actn1Q7TPR4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actn1Q7TPR4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms