Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb3Q6XAS4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb3Q6XAS4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb3Q6XAS4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb3Q6XAS4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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