Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ssx9Q6XAS3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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