Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja6Q6S5G4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gja6Q6S5G4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms