Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1a2Q6PIE5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a2Q6PIE5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms