Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtifQ6PEE2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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