Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PdgfrlQ6PE55 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfrlQ6PE55 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms