Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sarm1Q6PDS3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sarm1Q6PDS3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms