Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trak1Q6PD31 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trak1Q6PD31 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms