Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smchd1Q6P5D8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smchd1Q6P5D8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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