Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slx4Q6P1D7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slx4Q6P1D7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms