Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms