Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Asic1Q6NXK8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Asic1Q6NXK8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms