Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sp140Q6NSQ5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp140Q6NSQ5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms