Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt40Q6IFX3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms