Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cep290Q6A078 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms