Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nlrp4eQ66X19 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms