Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ino80dQ66JY2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ino80dQ66JY2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms