Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atp2a3Q64518 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2a3Q64518 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms