Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pan3Q640Q5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms