Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Itga3Q62470 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms