Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms