Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm20865Q62460 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm20865Q62460 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm20865Q62460 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Gm20865Q62460 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20865Q62460 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms