Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ndufa4Q62425 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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