Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ss18Q62280 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms