Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp1Q62209 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp1Q62209 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms