Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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PtprrQ62132 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PtprrQ62132 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms