Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Odf1Q61999 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Odf1Q61999 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Odf1Q61999 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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