Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Npm1Q61937 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms