Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms