Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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AtrxQ61687 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrxQ61687 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrxQ61687 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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