Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ecm1Q61508 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms