Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcd1Q61466 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms