Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vsx2Q61412 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vsx2Q61412 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms