Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PcolceQ61398 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms