Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsg101Q61187 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms