Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usf1Q61069 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usf1Q61069 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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