Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Neurod1Q60867 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms