Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd4Q60688 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd4Q60688 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms